AF-EU-20013 | Identification of functionally active genome features relevant to phenotypic diversity and plasticity in cattle

Bert van ReesEU-projecten, Project

Projecttitel: Identification of functionally active genome features relevant to phenotypic diversity and plasticity in cattle: BovReg
Projectnummer: AF-EU-20013
Missie: Sleuteltechnologie Biotechnologie en veredeling
Looptijd: 2019- 2023
Projectleider: Roel Veerkamp
Kennisinstelling: Wageningen University & Research
Betrokken partijen: Leibnitz Institut fur Nutztierbiologie, Funcacio Centre de Regulacio Genomica, Institute National de Recherche Agronomique, Daigenode, Universite de Liege, Eidgenoessische Technische Hochschule Zurich, Aarhus Universitet, Luonnonvrakeskus, Instytut Genetyki I Hodowli Zwierzat Polskiej Akademii Nauk, Universiteit Utrecht, European Molecular Biology Laboratory, European Association for Animal Production, University of Alberta, University of Edinburgh, Stiftung Tierartzliche Hochschule Hannover, Department of Primary Industries Victoria, Unversite de Limoges, Faculdade de Medicina Veterinaria, Edinethics


Ondanks de revolutie in genoomanalyse is er nog een groot gebrek aan kennis over het begrijpen van de associaties tussen het genoom en complexe de fenotypes die van belang zijn voor de fokkerij. Het BovReg-consortium gebruikt ‘whole genome associatie mapping”  om kandidaat regio’s te identificeren  die genexpressie in relevante tissues, intermediaire fenotypes (biomarkers) en de uiteindelijke kenmerken robuustheid, gezondheid en biologische efficiëntie reguleren. Ook worden epigenetische regulatie in deze regio’s onderzocht. Deze kennis is van fundamenteel belang voor het gebruik van genetische variatie in nieuwe systemen.  Verder wordt de vervolgstap gezet de huidige fokwaardeschattingmodellen aan te passen zodat ze  deze kennis over de biologische regulatie mee kunne nemem door a priori een gewicht te geven aan genomische regio’s (of SNP) op basis van de biologische functie. Dit is vooral belangrijk in situaties waar geen grote referentiepopulatie beschikbaar, bijvoorbeeld nieuwe kenmerken of kleinere rassen. Deze verbeterde kennis zal nuttig zijn voor het heroriënteren van de veehouderij, volledig rekening houdend met maatschappelijke randvoorwaarde, milieu- en dierenwelzijnsaspecten en biologische efficiëntie.

Deel dit bericht